バイオプロスペクティングは、伝統的な医薬品を商品として開発することです。先進国の製薬会社は、商業用医薬品として開発できる、伝統的な治療法に含まれる化学的に活性な成分を探すことがよくあります。これは、先住民の知識を悪用していると信じる人々から「生物海賊行為」として激しく批判されています。彼らは、企業が元の使用者を認識せずに、伝統的な治療法に由来する薬を利用しようとする可能性があるという事実を指摘しています。製薬会社による研究開発への巨額の投資が製薬会社にこの権利を与えていると主張する人もいる。最近の事例では、医薬品の従来のユーザーと製薬会社との間で合意が形成されています。たとえば、フーディアは南アフリカのサン族が狩猟や長旅の際に食欲抑制剤として使用する植物です。サンとフーディアをベースにした製品の開発に興味を持っていた製薬会社ファイザーとの間には長い交渉があった。サンは最終的に、フーディアをベースにしたあらゆる製品からロイヤルティを受け取る権利を獲得した。
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